La Universidad de Piura es una obra de apostolado corporativo del Opus Dei; es decir, una institución promovida por personas del Opus Dei y muchas otras, católicas y no católicas, en la cual los contenidos relacionados con la fe católica de las enseñanzas académicas y profesionales, están garantizados moralmente por la Prelatura del Opus Dei.

Esta realidad no modifica en absoluto la naturaleza civil de la Universidad de Piura. Es decir, la responsabilidad plena de su gestión y dirección corresponde siempre a la Udep, y no a la Prelatura del Opus Dei.

El Opus Dei es una Prelatura personal de la Iglesia Católica, fundada por San Josemaría Escrivá de Balaguer, que tiene como fin promover la búsqueda de la santidad a través del trabajo profesional y de las realidades corrientes. El espíritu del Opus Dei, por tanto, anima la vida y actividades de la Universidad con su inspiración cristiana, lo que significa que se fomenta el respeto a la libertad de las conciencias, el amor a la Iglesia, la unidad de vida y la práctica de las virtudes.

El actual Obispo Prelado del Opus Dei es Mons. Javier Echevarría, nombrado por el Papa Juan Pablo II el 20 de abril de 1994. Además, Mons. Echevarría es Gran Canciller de la Universidad de Piura.